Lo scavo ha permesso di individuare diverse fasi di frequentazione dell'area conuso cemeteriale-religioso, nonchè strutture murarie che hanno preceduto la costruzione della chiesa attuale.

La fase più antica della costruzione pare testimoniata da una tomba monumentale, ubicata presso l'altare maggiore. Sono stati individuati i resti dell'abside rettangolare di un edificio con paramento murario a conci squadrati, contrafforti angolari e cordolo sagomato a scopo decorativo. L'abside di questo edificio, parzialmente conservato, fu ricoperta con volta a botte in pietre e gesso ed utilizzata come cripta come confermano i ritrovamenti, costituiti da medaglie, monete e crocefissi.

La prosecuzione dello scavo nella navata della chiesa ha permesso di individuare 13 sepolture e 2 cripte. le tombe sono tutte scavate nella roccia: 5 hanno pianta rettangolare, 3 presentano l'incavo del cranio sul lato breve. Alcune tombe sono state riutilizzate più volte in tempi diversi e non sempre definibili; altre sono state modificate per costruire le cripte nel XVIII secolo.

Dietro l'altare maggiore, sotto la pavimentazione attuale, è stata individuata una pavimentazione precedente con rifasci marginali in pietra nera, piastrelle esagonali in terracotta e piastrelle quadrate in maiolica verde. Al disotto di questa pavimentazione, a -m. 1,65, è stato oindividuato un tratto di acciottolato relativo alla strada in pedende che potrebbe essere la strada medievale su cui si apriva la chiesa con abside rettangolare.

Nel corso della prima fase dei lavori lo scavo èstato esteso ai tre ambienti della sagrestia, dove sono state individuate altre tombe e nel giardino, ubicato all'angolo nordest della chiesa.

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